Проверка может быть инициирована по жалобе пациента или при поступлении сигнала о возможной угрозе здоровью. Основанием служит официальное обращение, выявленные проблемы в результате плановых наблюдений или решения прокурорских органов. Часто ВКК проводится после посещения клиники лицом, представляющим законного представителя пациента или проверяющим под видом потребителя.